根据化学性质，主要分为氧化性杀菌剂和非氧化性杀菌剂两大类。

1. 氧化性杀菌剂
通过强烈的氧化作用破坏微生物的细胞结构，杀灭速度快，但通常不具有持久性。

• **（Cl₂）：传统、经济，但运输和使用有安全风险。

• 次氯酸钠（NaClO）：俗称漂白水，使用安全方便，是**的常见替代品。

• 二氧化氯（ClO₂）：高效、广谱，杀菌效果不受pH值影响，不产生致癌的三卤甲烷，是更优的选择。

• 臭氧（O₃）：极强的氧化性，消毒效果好，但无法持久，需现场制备。

• 溴类杀菌剂：如溴氯二甲基海因，在碱性或高pH值水中的效果优于氯。

2. 非氧化性杀菌剂
通过特殊的机理作用于微生物的特定部位，作用持久，针对性强，通常用于冲击式投加，以解决氧化性杀菌剂难以处理的顽固微生物问题。

• 季铵盐：如十二烷基二甲基苄基氯化铵（1227），具有吸附、渗透作用，能破坏细胞膜，同时具有很好的剥离粘泥的效果。

• 异噻唑啉酮：如卡松（CMIT/MIT），广谱高效，能抑制蛋白质的合成，使用剂量低。

• 戊二醛：广谱杀菌，尤其对硫酸盐还原菌有效，性能稳定。

• 双胍类：如聚六亚甲基双胍，具有吸附和杀灭双重作用。

• 溴硝基丙二醇（BNP）：快速杀灭兼有良好剥离性能。

•